וולפגנג גוגנברגר נולד בזונטהופן שבמחוז אלגוי, דרום גרמניה. הוא זכה בפרס הראשון בתחרות הארצית „Jugend musiziert" ("נוער מנגן") ובפרס האירופי של התחרויות הלאומיות למוזיקה לנוער. בשנת 1978 התבלט כזוכה פרס ומלגה בתחרות היוקרתית „Deutscher Musikwettbewerb" (התחרות הגרמנית למוזיקה). מלגות ופרסי עידוד תרבות רבים ליוו את דרכו המקצועית של וולפגנג גוגנברגר, אשר סיים את לימודיו בהצטיינות בקונסרבטוריון ע"ש ריכארד שטראוס במינכן אצל רולף קווינקה, ולאחר מכן בבית הספר הגבוה למוזיקה בטרוסינגן אצל פרופ' הורסט-דיטר בולץ. תקופת לימודים אינטנסיבית בת שנתיים באוניברסיטת נורת'ווסטרן שבשיקגו, אצל וינסנט צ'יחוביץ', אדולף הרסת' וארנולד ג'ייקובס, הייתה עבורו הן מכוננת מבחינה אמנותית והן פורצת דרך. כחבר ברשימת האמנים של המועצה הגרמנית למוזיקה, הופיע וולפגנג גוגנברגר כסולן עם תזמורות גרמניות מוכרות. ניסיונו כנגן תזמורת נצבר בתקופת כהונתו בפילהרמונית של וירטמברג (חצוצרן ראשי), וכן בהופעות אורח נוספות עם התזמורת הסימפונית של רדיו הסן (HR), תזמורת הרדיו של מינכן (BR), הפילהרמונית של אאוגסבורג, התזמורת הקאמרית של וירטמברג וקולגיום באך שטוטגרט. כמורה ומרצה מבוקש, הועברו על ידו כיתות אמן באוסטריה, שווייץ, איטליה, דנמרק, נורווגיה, שוודיה, פולין, ליטא, אסטוניה, רוסיה, גאורגיה, דרום-מזרח אסיה, ארה"ב ומקסיקו. לצד הקלטות רדיו שונות, פרסם וולפגנג גוגנברגר שלושה תקליטורים של מוזיקה סולנית וקאמרית. בשנת 2004 יצא לאור ספר הלימוד לחצוצרה שלו „BASICS PLUS" (הוצאת רונדל), שהפך מאז לחלק מהרפרטואר הסטנדרטי בהוראת כלי הנשיפה ממתכת. בשנת 2026 פרסם את „BASICS PLUS 4.0" (הוצאת מרטין שמיד למוזיקה), ספר לימוד הכולל תרגילים בארבעה קולות, נגינות ליווי, טקסטים וסרטונים בנושאים שונים הקשורים לטכניקת הנשיפה ולהיבטים המנטליים של הנגינה. החל משנת 1986 שימש וולפגנג גוגנברגר כמרצה לחצוצרה וכראש המחלקה לכלי נשיפה ממתכת ותופים בקונסרבטוריון ע"ש ריכארד שטראוס במינכן, עד שבשנת 2005 נענה לקריאה לשמש פרופסור בבית הספר הגבוה הממלכתי למוזיקה בטרוסינגן. עד לפרישתו בשנת 2023 עמד שם בראש המכון „Positively Brass & Percussion", המארגן החל משנת 2015 את הסימפוזיון הבינלאומי „Positively Brass & Percussion Symposium". כמו כן ניהל את אנסמבל החצוצרות של בית הספר הגבוה למוזיקה בטרוסינגן, שעבורו נכתבו מספר יצירות מוזמנות המושמעות בתקליטור „Kaleidollage" (הוצאת Rundel compact). בין השנים 2018–2022 כיהן וולפגנג גוגנברגר כפרופסור אורח באקדמיה הנורווגית למוסיקה, המוסד הממלכתי הגבוה למוזיקה באוסלו.